主線任務(wù)

　　James Heller是一名普通的特種士兵，他原本擁有一個(gè)幸福的家庭，然而這一切都在紐約市的病毒傳播事件中被毀滅殆盡。幾乎失去了一切的James。在一次小隊(duì)行動(dòng)中遇到了前代主角Alex mercer，小隊(duì)的成員幾乎全滅，Alex在唯一幸存的James身上注入了自己不一樣的病毒——紅光病毒，使得James具有了與Alex不相上下的超能力。

　　游戲界面當(dāng)James再度醒來時(shí)，他發(fā)現(xiàn)自己已經(jīng)變成了軍方的重要試驗(yàn)品，上級想把他作為樣品以研究Alex的超能力，困惑不解的James擊敗了軍方放出的變異體并逃出了實(shí)驗(yàn)室。在路上他再次遇到了Alex，Alex告訴他迄今為止的所有事件全都是一支名為黑色守望的軍事組織在從中作梗，Alex希望James能幫助自己一起對抗他們。然而James對Alex半信半疑，隨后，自己的情報(bào)人古拉神父也證實(shí)了Alex的話，James開始利用自己的超能力一步步調(diào)查黑色守望和整個(gè)事件的真相。

　　隨著調(diào)查的不斷深入，James發(fā)現(xiàn)Alex的嫌疑越來越大，在吸收了一個(gè)名為科尼博士的變異體之后，James終于確定Alex才是病毒事件的真兇，Alex的真正目的，是創(chuàng)造和自己一樣的變異人類，把他們訓(xùn)練為自己統(tǒng)治整座城市的得力部下!得知自己差點(diǎn)上當(dāng)受騙的James怒不可遏，發(fā)誓要摧毀Alex的陰謀。

　　然而此時(shí)的Alex也發(fā)現(xiàn)了James的態(tài)度轉(zhuǎn)變，并搶先一步殺害了James的重要同伴古拉神父，正當(dāng)James悲痛不已的時(shí)候，他突然接到了一個(gè)陌生女子的電話，這個(gè)女人正是Alex的妹妹Dana，Dana愿意幫助James提供情報(bào)，她告訴James其實(shí)他的女兒并沒有死，而是落到了黑色守望的手里，具體藏匿的地點(diǎn)和下落需要James自己去調(diào)查。為了自己的女兒，James重新振作了起來。

　　由于事態(tài)的不斷惡化，黑色守望決定啟動(dòng)“火鷹計(jì)劃”摧毀整個(gè)紐約市，以殺死150萬平民的代價(jià)制止病毒的繼續(xù)蔓延。一想到自己的女兒仍然被關(guān)在這個(gè)城市的某一個(gè)角落，James竭盡全力阻止了軍方企圖摧毀紐約的計(jì)劃，保證了整個(gè)城市和自己女兒的安全。

　　為了救出女兒，James化身為一位名為萊利的中尉，從黑色守望的重要指揮官魯克斯那里獲取到了各種關(guān)于女兒的情報(bào)，就在James認(rèn)為魯克斯已經(jīng)構(gòu)成阻礙打算把他滅口的時(shí)候，在一次無意中聽到的談話中，James發(fā)現(xiàn)魯克斯跟自己一樣是一位有妻有女的父親，心軟的James因此放了魯克斯一馬。后來魯克斯認(rèn)為“萊利”玩忽職守，把裝扮成萊利的James叫來訓(xùn)話，James露出真身。魯克斯雖然對James的所作所為十分惱怒，一番掙扎后，還是決定將James的女兒偷偷地交還給他。然而就在這時(shí)Alex的部下突然闖進(jìn)來將James的女兒再次劫走，Alex以此為要挾，約James在一處摩天大樓的直升機(jī)起降平臺上見面。

　　在天臺上，James見到了幾近瘋狂的Alex，Alex吸收了自己所有的部下，使自己的身體達(dá)到了極限狀態(tài)，而James毫無懼色，一次又一次擊退了Alex的攻擊，最終，James斬?cái)嗔薃lex的雙臂，并將他完全吸收。繼承了Alex所有記憶的James釋放出了驚人的力量，他的體內(nèi)爆發(fā)出了無數(shù)觸須，細(xì)長的觸須在大街小巷四處延伸，幾乎摧毀了城市里所有的變異體。

　　在游戲結(jié)尾，James將女兒拜托給Dana照顧，自己則準(zhǔn)備獨(dú)自離開，他不想讓女兒看到近乎怪物的自己。然而在James臨走時(shí)，女兒從背后一把抱住了他。最終，James牽著女兒的手，和Dana一起眺望遠(yuǎn)方的朝陽，Dana問他以后該怎么做，James沒有回答她，毫無疑問，自己和女兒，今后還有很長一段路要走。

　　支線任務(wù)

　　在游戲中，較前作新增加了支線的收集任務(wù)和“黑網(wǎng)記憶”，收集品在地圖上會以白色波紋的波動(dòng)來顯示，玩家可通過白色波紋每次顯現(xiàn)的位置來確定收集品的位置所在并加以收集。而“黑網(wǎng)記憶”則會以金色五角星顯示。每個(gè)地區(qū)的支線任務(wù)和收集品完成后都會給予玩家一定的EP獎(jiǎng)勵(lì)和能力突變來強(qiáng)大玩家的自身力量。

　　收集品：

　　1、黑匣子：通過尋找在各個(gè)地點(diǎn)意外死亡的黑色守望士兵的尸體來找到黑色守望軍隊(duì)內(nèi)用來作電子記錄的“

　　“黑網(wǎng)記憶”黑匣子”，可以通過它們來了解黑色守望內(nèi)的各種奇聞異事及情報(bào)。

　　2、戰(zhàn)場特工：黑色守望派在指定地點(diǎn)用以研究感染物的科學(xué)家們，旁邊跟著一群守衛(wèi)著他們的黑色守望士兵，摧毀他們來終止黑色守望的平民實(shí)驗(yàn)。

　　3、巢穴：以海勒的話來說，就是“一個(gè)臟得要死的洞”，實(shí)際上是所有感染者在各個(gè)區(qū)域所設(shè)下的基地，和一代的母巢相去不遠(yuǎn)，通過摧毀洞穴可以緩解每一個(gè)區(qū)域的感染程度，也可以提升海勒的實(shí)戰(zhàn)能力。

　　黑網(wǎng)記憶：

　　通過海勒的探索能力，來尋找黑色守望的一些大人物，吸收他們可以獲取黑色守望的一些由“赤色皇冠”(Red Crown)下達(dá)的計(jì)劃情報(bào)，阻止他們來保證自己及線人的安全。