后三只精靈會因應我方開始選擇的精靈而出現(xiàn)影響

　　開始選：

　　a.小火龍 b.杰尼龜 c.妙娃種子 的話，小茂后三只就會分別對應是：

　　a.風速狗,椰蛋樹,水箭龜

　　b.暴鯉龍,風速犬,妙娃花

　　c.椰蛋樹,暴鯉龍,噴火龍

　　前三只則不變

　　支線劇情（新增劇情）：

　　打敗第7個道館的首領后，出道館時會有一個人叫住你，要帶你去一個島嶼……選定是后，他就會帶你上船，然后去一個島嶼（記得帶上會沖浪的精靈）。下船后來到PC屋里被告知島上的電力出現(xiàn)問題，需要兩塊寶石來修復，所以現(xiàn)在是不能使用電腦的。

　　1號島：在北部看見一個山洞，洞內有溫泉，泡溫泉可以恢復精靈的體力，而且上面的那個老爺爺還會給你6號秘傳機器（碎石）。出來后繼續(xù)往北走，發(fā)現(xiàn)一座山。走到山頂，出乎意料，山頂居然有一只火焰鳥（Lv50）！收復它然后回到1號島的 PC恢復，接著坐船到2號島。

　　2號島：到了2號島，發(fā)現(xiàn)一座特殊的房子（如圖），進去之后有事件發(fā)生，主人家的小孩去3號島采集至今未歸家所以請求你幫助尋找。在這所特殊的房子左邊的那個房子里，可以讓精靈學習以前的招式，條件是兩個小香菇，一個大香菇（可以從派拉斯身上獲得），就和以前心靈鱗片一樣。另外這個小島的山頂上有個人可以教給精靈三種厲害的招式，別錯過（只有主角精靈能學）。然后再坐船去3號島。

　　3號島：到了3號島，看到單車黨，單車黨與居民發(fā)生沖突，后來與單車黨交手。解決他們之后，居民為了答謝，送給我禮物！再往西北邊走，看見一片樹林，在樹林里找到了小女孩，突然這時有一只Lv30的素利普跳了出來，打敗它之后救出小女孩。把小女孩送回她家。他爸爸為表感謝，送了件禮物給我！再回到1號島的大型PC里最后被人送回了紅蓮島。

　　通關一遍，抓住超過60種精靈，然后去博士那里升級成386版圖鑒，之后到港口坐船去第一個小島的火焰山，右邊有兩個火箭隊隊員，打敗他們進入山洞，在山洞中要使用秘傳機04怪力推石頭后才能到達深處，得到紅寶石?；厝ピ?號島的PC把寶石給博士（如圖），便得到船票，之后可以坐船去7個島。

　　4號島：在4號島一下船就會遇見對手小茂，但說了幾句就跑了……值得注意的是，在這個小島可以養(yǎng)精靈（如圖）^_^然后到商店旁邊的屋子和里面的人對話，再用沖浪過右面的一個小湖，來到一個冰洞。注意，洞內有些地方需要踩冰，踩兩次就會掉到下一層。另外還有滑冰，要利用冰塊上的石頭轉換方向。洞里可以拿到秘傳機器07（登瀑布），有個地方要使用登瀑布進去，之后可以遇見四天王之一—冰天王，旁邊還有火箭隊的人，與其談話后會發(fā)生戰(zhàn)斗，贏后會告訴你口令。得到冰天王的感謝后回到坐船那里，出發(fā)去5號島。