之后就如同開場動畫里那樣，索菲亞找到了女兒，并命令主角開槍自殺。雖然再通過很多測試后索菲亞認為變成Little Sister的經(jīng)歷對女兒沒有影響，但是主角與愛蘭諾的聯(lián)系卻是相當緊密。由于曾經(jīng)是Little Sister的一員，愛蘭諾可以指揮其他的Little Sister,就這樣愛蘭諾找回了主角的基因樣本，并在生命艙中復(fù)活，而她這么做則是被想要與主角相見的強烈愿望所驅(qū)使，主角也在這種愿望的驅(qū)使下開始尋找愛蘭諾。

      綁架事件之后，索菲亞繼續(xù)自己的計劃，她打算制造一個代表忠誠，犧牲并能被萬眾敬仰的偶像，經(jīng)過ADAM的改造這個偶像將獲取無憂城中所有的智慧，而這個偶像的行為將被作為所有人的準則，通過先期的人體試驗和之后志愿者的考核，偶像的人選浮出水面——亞歷山大。但是索菲亞和亞歷山大對這個實驗都沒有信心，經(jīng)過重重改造后這個人還剩下什么呢？索菲亞的答案是直覺。而亞歷山大干脆留下了毀滅自己的線索。

      改造女兒、制造偶像都需要大量的ADAM，而59年后無憂城已是廢墟，于是索菲亞開始綁架陸地上的小女孩制作Little Sister，而那些長大的Little Sister則被改造成Big Sister。因為女兒被綁架，本已逃回地表的辛克萊爾再次回到了無憂城。     
     
      在辛克萊爾和愛蘭諾的指引下，主角開始了尋找愛蘭諾的過程，期間你可以遇到把愛蘭諾丟掉的保姆Grace和線人斯坦利，由于主角一路解救Little Sister而且愛蘭諾也因為主角的到來開始拒絕索菲亞的指示，于是索菲亞發(fā)動城中自己的支持者來除掉主角。最后在愛蘭諾房前，索菲亞利用主角與愛蘭諾身體上的聯(lián)系，先將愛蘭諾窒息，將主角打倒。在主角被困期間，愛蘭諾利用自己與Little Sister的聯(lián)系，使主角俯身于Little Sister上，去尋找Big Sister的裝備。當愛蘭諾穿著Big Sister的裝備將主角救出時，也徹底宣告了索菲亞夢想的破滅。眼見自己所創(chuàng)造的一切又將回到自己所唾棄的地表，索菲亞打算將一切毀滅，先是抓住了辛克萊爾并將其改造為Big Daddy，并試圖破壞逃生用的潛艇，但是主角們在許多Little Sister的幫助下，還是回到了海面上，而索菲亞也有了一個回到陸地的機會。

      和一代的Boss一樣，反角的動機并不邪惡，而主角和愛蘭諾的父女之情卻是人為地設(shè)定。單純的夢想實現(xiàn)的卻并非善良，而執(zhí)著的信念起因卻并不單純。也許就和道德虛無論者說的那樣：人人有權(quán)爭輸贏，但無人有權(quán)定對錯。

     個人感覺這代戰(zhàn)斗系統(tǒng)不太平衡，中等難度前期可能還要用槍，后期直接就是冰凍加鉆頭，身上金錢常駐800，ADAM留了一千多沒用。而且走善良路線的人估計會很多，因為我真的不會對一個跑來跑去管我叫爸爸的小女孩下手。

結(jié)局悲劇   主角（老大爹）
最后死了