魔獸手冊：自動記錄戰(zhàn)斗過的敵人的屬性等資料。對打倒過的敵人還會記錄“情報”回路能看到的部分。

地名收集：通過對話或?qū)嶋H探索會自動記錄。

戰(zhàn)斗語音：添加了和PC版SC有語音角色對應(yīng)的戰(zhàn)斗語音（注：有我方可控角色8人及敵方喬絲特、亞妮拉絲、克魯茨、洛倫斯少尉、理查德上校的語音。約修亞、洛倫斯少尉的部分語音和PC版SC略有不同）（鏡靜夢 指正）。

繼承存檔：繼承FC的通關(guān)存檔開始游戲，可以選擇繼承米拉、耀晶片、物品、裝備、手冊、人物狀態(tài)、敵人強度。

難度變更：通關(guān)后，出現(xiàn)HARD和NIGHTMARE難度。

其他：

前輩游擊士有了頭像（注：亞妮拉絲、克魯茨、卡露娜、庫拉茨）。柏斯的游擊士斯丁克外形更改（注：PC版在柏斯的斯丁克錯用成了克魯茨的外形）。

制作料理的時候會出現(xiàn)艾絲蒂爾廚師的形象。

裝備鷹目回路時可以在小地圖上顯示敵人位置。

部分敵人的能力和抗性有一定變更。

開始游戲時的標題畫面背景會隨機出現(xiàn)5個地區(qū)的畫面之一。

補充：

戰(zhàn)斗中選擇“逃跑”時會有確認操作，而非直接逃跑（pockle01補充）。