魔獸手冊(cè)：自動(dòng)記錄戰(zhàn)斗過的敵人的屬性等資料。對(duì)打倒過的敵人還會(huì)記錄“情報(bào)”回路能看到的部分。

地名收集：通過對(duì)話或?qū)嶋H探索會(huì)自動(dòng)記錄。

戰(zhàn)斗語音：添加了和PC版SC有語音角色對(duì)應(yīng)的戰(zhàn)斗語音（注：有我方可控角色8人及敵方喬絲特、亞妮拉絲、克魯茨、洛倫斯少尉、理查德上校的語音。約修亞、洛倫斯少尉的部分語音和PC版SC略有不同）（鏡靜夢(mèng) 指正）。

繼承存檔：繼承FC的通關(guān)存檔開始游戲，可以選擇繼承米拉、耀晶片、物品、裝備、手冊(cè)、人物狀態(tài)、敵人強(qiáng)度。

難度變更：通關(guān)后，出現(xiàn)HARD和NIGHTMARE難度。

其他：

前輩游擊士有了頭像（注：亞妮拉絲、克魯茨、卡露娜、庫(kù)拉茨）。柏斯的游擊士斯丁克外形更改（注：PC版在柏斯的斯丁克錯(cuò)用成了克魯茨的外形）。

制作料理的時(shí)候會(huì)出現(xiàn)艾絲蒂爾廚師的形象。

裝備鷹目回路時(shí)可以在小地圖上顯示敵人位置。

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開始游戲時(shí)的標(biāo)題畫面背景會(huì)隨機(jī)出現(xiàn)5個(gè)地區(qū)的畫面之一。

補(bǔ)充：

戰(zhàn)斗中選擇“逃跑”時(shí)會(huì)有確認(rèn)操作，而非直接逃跑（pockle01補(bǔ)充）。