玩家在非戰(zhàn)斗的狀態(tài)下，還可以對戰(zhàn)陣設置進行組合調整，每種戰(zhàn)陣對每個人物所增添的效果各有不同，而每個人物在同一個戰(zhàn)陣內也有不同的戰(zhàn)斗模式可以調整，如：防御、主攻等，玩家可根據(jù)自身需求進行設置。

　　本作中依然有軒轅劍戰(zhàn)斗中的特色：收妖。不僅可以在戰(zhàn)斗中將妖物收取后煉化成為實用材料，還可以煉制成為更加強大的妖怪，在戰(zhàn)斗中作為護駕使用。但是，收妖時需要停止戰(zhàn)斗動作才可以進行，對于玩家在戰(zhàn)斗中的速度與體驗也有著一定影響。而在本作中，這種需要暫停戰(zhàn)斗動作才能進行的收妖操作得到了改變。玩家可在戰(zhàn)斗中召喚出阿奇前來收妖，而阿奇的收妖動作與玩家的戰(zhàn)斗操作相互獨立且互不干涉，并不影響戰(zhàn)斗的進行。

　　同時，在以往《軒轅劍》游戲中，玩家在戰(zhàn)斗中成功使用收妖系統(tǒng)收服的敵人，皆可以在戰(zhàn)斗前設置為護駕，并出現(xiàn)在下一場戰(zhàn)斗中。但是部分頭目級別的強力敵人，要么非常難以收服，要么則是無法被收服使用。而在本次游戲中，因戰(zhàn)斗方式的變化，護駕系統(tǒng)也相應做了改變與提升。玩家只要成功達成特殊任務的挑戰(zhàn)，便可讓這些頭目級的怪物化身為個人護駕。游戲設置中，玩家可按照個人喜好分配設置6位護駕欄的歸屬，而在戰(zhàn)場上則最多可同時存在2位護駕。每當有護駕被擊退時，剩余的護駕便會依照先前設置的順序遞補上場。不僅如此，本次游戲中，護駕能夠使用各種技能攻擊敵人、為隊伍提供各種輔助及恢復等，讓玩家更輕松的進行戰(zhàn)斗。

　　在游戲中的四個主要角色，每位角色還具有獨有的天賦，當玩家操控并發(fā)動角色獨有天賦時，除了對戰(zhàn)斗有直接性的影響外，如：降低敵方血量、給予敵方減益狀態(tài)、獲得特殊秘寶等。還會觸發(fā)特殊的驚喜狀況，如：快速閃避、不讓敵人發(fā)現(xiàn)等。

　　本次的煉化機制回歸也系列早期設定，玩家能夠更加便捷更加明確地通過煉化規(guī)則來嘗試煉制新的產物。本作煉化必須采用兩只戰(zhàn)斗中收化成功的靈物來進行，煉化后的靈物各項能力數(shù)值和戰(zhàn)場表現(xiàn)優(yōu)于直接收化成功的靈物。特別需要注意的是，靈物之外的道具則無法應用于煉化中。